1. Автономная некоммерческая организация "Архитектурно-проектное бюро"
2. Алтайская региональная спортивно-патриотическая общественная организация "Арктика"
3. Общественная организация "Алтайская краевая ассоциация по борьбе с наркоманией и наркобизнесом"
4. Общественная организация "Федерация пожарно-прикладного и спасательного спорта Алтайского края"
5. Алтайское Краевое Некоммерческое Партнерство "Строительная Кампания "Приозерное"
6. Барнаульская объединенная организация общероссийского профессионального союза работников автомобильного транспорта и дорожного хозяйства"
7. Алтайская краевая общественная организация в поддержку родительства, детства и раннего развития детей "Здоровей-ка"
8. Некоммерческое партнерство Алтайский краевой историко-технический клуб стендового моделизма "Пластмастер"
9. Алтайский краевой общественный фонд "Ветеранов Чечни и локальных войн"
10. Некоммерческое партнерство "Специализированная Организация РосЭксперТиза"
11. Некоммерческое партнерство "Ассоциация пассажирских перевозчиков Барнаула"
12. Некоммерческое партнерство "Инновационно-производственный технологический парк "Бийск"; Алтайская региональная общественная организация по предотвращению насилия "Право на счастье"
13. Алтайская региональная общественная организация родителей, воспитывающих детей с синдромом Дауна "Солнечный Круг"
14. Автономная некоммерческая организация "Свободный доступ к общедоступной информации"
15. Алтайская региональная общественная организация "Институт социальных проблем"
16. Городская общественная организация по поддержке Многодетных и малообеспеченных семей города Бийска Алтайского края
18. Некоммерческое партнерство "Объединение учреждений здравоохранения и фармацевтической деятельности Алтайского края"
19. Алтайская региональная общественная организация реабилитации алко-наркозависимых лиц "Мир без наркотиков - это Успех"
20. Бийская городская общественная организация по поддержке многодетных и малообеспеченных семей "Доброе сердечко"
Одновременно с этим по решениям судов из Единого государственного реестра юридических лиц в марте 2012 года управлением Минюста были исключены 10 некоммерческих организаций, которые по решению суда признаны ликвидированными либо прекратившими свою деятельность в качестве юридического лица:
1. Алтайская краевая общественная организация "Центр башкирской культуры "Курай"
2. Новоалтайская городская общественная организация "Спортивный футбольный клуб "Новоалтайск"
3. Алтайская краевая общественная организация "Лига ветеранов подразделений по борьбе с организованной преступностью"
4. Автономная некоммерческая организация "Научно-практический центр Регионэнергосервис"
5. Егорьевское станичное казачье общество Алтайского отдельского казачьего общества войскового казачьего общества "Сибирское казачье войско"
6. Некоммерческое партнерство "Союз предпринимателей города Новоалтайска"
7. Общественный благотворительный фонд "Развитие" села Ая
8. Общественная организация "Алтайский краевой стрелково-спортивный клуб" Регионального отделения Общероссийской общественно-государственной организации ДОСААФ России Алтайского края
9. Социальный фонд
10. Ассоциация Алтайских переработчиков вторичных металлов
Также управление Минюста в связи с решением ФНС исключило из своего ведомственного реестра Алтайский Региональный Общественный Фонд Содействия Развитию Науки, Инноваций, Технологий "АНИТА" Общественная первичная организация профсоюза работников агропромышленного комплекса РФ АГАУ (студентов) Барнаула.
