Внешнеторговый оборот региона в прошедшем году составил $15,5 млн и уменьшился на 30% (или на $8,8 млн по сравнению с 2008 годом). Во внешней торговле региона преобладает экспорт - $13,3 млн (85,8%), импорт - $2,2 млн (соответственно 14,2%).
Экспортная составляющая возросла более чем на $1 млн, что связано с привлечением новых участников внешнеэкономической деятельности (ВЭД).
В 2009 году внешнеторговые операции на территории Республики Алтай осуществлял 91 участник ВЭД, что на 36% меньше уровня 2008 года. В 2008 году экспортно-импортные операции осуществляли 144 участника ВЭД.
Несмотря на это, грузооборот по сравнению с 2008 годом увеличился на 74% и составил 41 754 тонны (в 2008 году - 23 451).
Основные торговые партнеры региона при импорте - Монголия (удельный вес 96,5%) и Китай. Ведущее место при экспорте у Республики Корея (48,5%), далее следуют Монголия (29%) и Гонконг (21%)
В экспорте наибольший удельный вес заняли фармацевтическая продукция и минеральное топливо. В импорте основные группы товаров: консервы из мяса и мумие-сырец (необработанное).
На 26% увеличилось количество физических лиц, пересекающих границу в регионе деятельности таможни. В 2009 году оформлено 41 714 физических лиц, следующих через границу (в 2008 году - 33 069).
Количество оформленных транспортных средств выросло на 36%. За год оформлено 11 371 транспортное средство (в 2008 году - 8 387). Таможенными постами оформлено 426 грузовых таможенных деклараций (в 2008 году - 516).
Особое место в деятельности таможенного органа занимает работа правоохранительного блока, направленная на выявление, пресечение и предупреждение правонарушений и преступлений.
По оперативной информации и при непосредственном участии сотрудников оперативнорозыскного отдела, отделением дознания Горно-Алтайской таможни было возбуждено 11 уголовных дел по фактам контрабанды товаров и транспортных средств, объектов, относящихся к культурным ценностям. Стоимость предметов контрабанды составила более 17 млн рублей.
В 2009 году отделением административных расследований таможни возбуждено 191 дело об административных правонарушениях.
В 2009 году проведено 47 проверок соблюдения валютного законодательства по 23 участникам ВЭД. Выявлено 98 случаев нарушения валютного законодательства на сумму 244 523,73 тысяч рублей. Возбуждено 24 дела об административном правонарушении на сумму 192 056,96 тысяч рублей. По делам об административных правонарушениях, возбужденных Горно-Алтайской таможней, Межрегиональным территориальным управлением Росфиннадзора в Алтайском крае наложено штрафов на сумму 1 491,87 тысяч рублей.
При участии сотрудников кинологического отдела таможни в 2009 году на МАПП Ташанта было осмотрено 9190 единиц автотранспорта.
Обнаружены и изъяты наркотические вещества общим весом более 500 гр, 6,3 кг незадекларированных лекарственных препаратов, две шкуры снежного барса (ирбиса), мясо.
